DDBJ Read Annotation Pipeline高次処理部 解析目的別ワークフローは、β版にて試験運用中です。
ゲノム解析
新型シークエンサで解読されたゲノム配列データを参照ゲノム配列にマッピング、SNPデータを出力します。
RNA-seq解析
新型シークエンサで解読された細胞中の遺伝子配列を参照ゲノム配列にマッピングし、発現量の定量、新規転写配列の同定を行います。DDBJ Read Annotation Pipelineでは、各遺伝子の発現量の定量化、既存のannotationとの構造比較を行うことが出来ます。
ChIP-seq解析
クロマチン免疫沈降法から得られた「ゲノムDNAとタンパク質の複合体」のゲノムDNAを新型シーケンサで解読し、ヒストンメチル化などクロマチン構造変化のエピジェネティックな修飾や転写調節因子のゲノム上の結合部位を、網羅的に解析する。
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